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l 應用廣泛
測序及片段分析的應用包括未知序列測定、已知序列的比較測序、雜合子分析(Heterozygote Detection)、SSCP分析(SSCP Analysis)、微衛星序列分析(Microsalite Analysis)、長片段PCR(分析Long PCR)等
l 自動化程度高
自動灌膠:在分析一個樣品前,泵自動沖掉上一次分析用過的膠,灌入新膠。
自動取樣:把待測樣品放到自動進樣器的樣品盤中,由計算機程序控制自動進樣。自動進樣器有48孔和96孔兩種樣品盤,其中96孔樣品盤與本公司9600型PCR儀的樣品盤*,所以經PCR循環測序反應的樣品可直接放到310測序儀中測序,此外特殊設計的樣品蓋可防止蒸發。
l 多色熒光毛細管測序技術:
由于采用四色熒光標記技術,使四個測序反應產物可以在一根毛細管內電泳,使毛細管測序成為可能,同時也大大提高了測序精度,即降低了同位素測序因泳道間遷移率差異對精度的影響。而且與377型遺傳分析儀一樣,310型遺傳分析儀也采用CCD攝像機作為檢測器,使每個樣品分析時間僅為2.5小時。
l 全自動電腦控制:
只需把測序樣品放到自動進器樣品盤中,輸入樣品信息,如:進樣次序、進樣時間和電壓,和數據分析模式,如:SSCP、微衛星序列、VNTRS、DNA序列分析等模式,其余的工作,如:灌膠、進樣、電泳、檢測、數據分析全部由電腦控制進行。此外電腦還控制電泳的溫度、電壓、時間,同步監測電泳的情況,在分析上一個樣品數據的同時還可以收集下一個樣品的數據。
l 豐富的應用試劑盒及軟件
Applied Biosystems公司提供多種應用試劑盒及應用軟件,如用于親子鑒定和個體識別的 Profiler Plus, Cofiler, SGM plus試劑盒,用于真菌鑒定分型的D2 rRNA測序試劑盒,用于器官移植配型分析的HLA基因測序試劑盒,用于細菌鑒定分型的16s rRNA測序試劑盒,用于愛滋病毒突變檢測及新藥研發的HIV Genotyping試劑盒,用于脆性X檢測的Fragile X試劑盒,用于單核苷酸多態性分析的SNapshot試劑盒,用于動植物育種、基因組作圖及差異顯示的AFLP試劑盒等,廣泛應用于人類、動植物、微生物等各項研究領域。
性能指標:
| 應用舉例 | 分離膠 | 毛細管 | 電泳時間及溫度 | 分辨大小 | 24小時產率 |
標準測序 | DNA測序 | POP-6 | 內徑50mm 長度61cm | 2.75 hr 50°C | 600Nt | 5220Nt |
快速測序 | 比較測序 | POP-6 | 內徑50mm 長度47cm | 60 min 50°C | 400Nt | 9120Nt |
片段大小分析 | 微衛星分析 差異顯示AFLPs | POP-4 | 內徑50mm 長度47cm | 30 min 60°C | 350Nt | 720個片段 |
VNTRs | 3.0%片段分析膠 | 內徑50mm 長度47cm | 21 min 30°C | 350Nt | 204個樣品 | |
突變檢測 | SSCP | 3.0%片段分析 10%甘油 | 內徑50mm 長度47cm | 20 min 30°C | 300Nt | 72個樣品 |
定量 | RT-PCR | 3.0%片段 分析膠 | 內徑50mm 長度47cm | 22 min 30°C | 1000Nt | 195個樣品 |
規格指標:
檢測系統:CCD檢測熒光波長范圍:525-650 nm
光源:氬離子激光光源 激發波長:488nm和4nm 激發功率:10mW
電泳電壓:100V – 15000V
灌膠泵:壓力可高達1,800psi
樣品盤:兩種規格:48孔或96孔
控溫板:毛細管溫度范圍:室溫-60°C
電腦:蘋果G3電腦或同級別電腦
打印機:Epson Stylus Color 900型或850型打印機
儀器尺寸:
電泳系統:寬度—60.96cm 高度—86.36cm 深度—55.88cm 重量—94.5kg
電腦系統:寬度—35.5cm 高度—45.5cm 深度—43.0cm 重量—27.50kg
打印機:寬度—46.75cm 高度—32.50cm 深度29.60cm 重量—8.33kg