水處理紫外線殺菌器的作用主要是對水進行消毒和凈化，其主要功能包括：
高效殺菌：紫外線對細菌、病毒的殺菌使用一般在一至二秒即可達到99%－99.9%的殺菌率。
高效殺菌廣譜性：紫外線殺菌的廣譜性高，它對幾乎所有的細菌、病毒都能高效率殺滅。
無二次污染：紫外線殺菌不加入任何化學藥劑，因此它不會對水體和周圍環境產生二次污染，不改變水中任何成分。
運行安全、可靠：傳統的消毒技術如采用氯化物或臭氧，其消毒劑本身就是屬于劇毒、易燃的物質，而紫外線消毒系統不存在這樣的安全隱患。
運行維護費用低：紫外線殺菌設備占地小，構筑物要求簡單，因此總投資較少，在運行方面成本也較低，在千噸水處理量水平，它的成本只是氯消毒的1/2。
此外，紫外線殺菌器在管道直飲水系統中也有重要作用。管道直飲水系統是一種通過管道將自來水或其他水源直接供應給用戶的系統，而紫外線殺菌器可以用于對這些供水管道中的水進行消毒和殺菌處理。在管道直飲水系統中，自來水或其他水源可能會受到細菌、病毒和其他微生物的污染。這些微生物可能來自水源本身、管道污染、維護不當或其他因素。如果未對水進行適當的消毒和殺菌處理，這些微生物可能會對人體健康造成潛在的風險。紫外線殺菌器通過將水流經過紫外燈管區域，利用UV-C波段的紫外線輻射來滅活或殺死水中的細菌、病毒和其他微生物。紫外線照射會破壞這些微生物的核酸結構，使其無法繁殖和生長，從而有效地殺滅這些微生物。
