1）顯微成像：可人工控制顯微圖片的觀察、拍攝、存儲并連續自動等間隔拍攝多達200張圖片。★具有實時預覽飽和警告、自動背景矯正特性。
2）★中文、拉丁文雙語顯示的藻類專家圖庫（共15個門、1647個屬、14831個種），已有藻類有效圖庫量18.3756萬張以上，各圖庫屬種和內容可自行擴充。
3）★藻類智能鑒定：具有有效地按圖像形狀、顏色、紋理等相似度來自動比對藻類圖像的智能式【以圖搜圖】特性。以及通過形態學搜索、模糊關鍵詞搜索、常見藻搜索、分類學搜索，經圖像、文字對比，快速鑒定藻類。能自動索引藻類的用戶計數表成所在流域小圖庫，使【以圖搜圖】更快捷。
4）★藻類計數及形態測量功能：a、浮游生物分類標記：采用不同顏色、不同大小的色圈標記各種浮游生物，并對200張所拍攝圖片內的各種浮游生物，按類點擊、自動累積計數（可合并不同倍率計數結果、多個樣品計數結果）；b、優勢種自動排序、按門（類）排序、優勢群落組成百分比分析；c、可自動計算香農-威納指數、均勻性指數、藻密度自動換算、浮游動物豐度自動換算；d、按大量形狀模型來輔助計算浮游生物的生物量（內置34種幾何模型，通過測量少量參數即可計算個體/細胞體積）。內置常見淡水藻、常見海洋藻等計數表，并可自行編輯、導出、導入計數表。可按視野面積、藻群體面積、浮游動物個體面積測量，按細胞直徑、藻絲、鞭毛長度、浮游動物體長及觸角測量，以及按枝角分枝角度測量等。
5）★微囊藻分析模塊能自動學習與自動分析團狀微囊藻群體的細胞數，并可自動計數顆粒性或單細胞微藻、鏈狀微藻細胞、線蟲等類的浮游動物。
6）★的景深擴展的多聚焦融合3D高清晰成像。多視野圖像的自動拼接、剪裁編輯修正特性。有藻類的顏色、形狀自動學習分類特性，可監視修正轉換藻類類別，并二次學習和保存分類特征。
7）具有浮游生物細胞的自動摳圖特性，可快速提取其主邊緣特征圖像。具有對模糊、重疊的浮游生物圖像的清晰化處理特性。
8）分析軟件具有在線自主升級的特性。