明渠式紫外線消毒原理是一用紫外線光子的高能波段的能量破壞水體中的各種病毒、細菌、病原體的DNA和RNA結構，使其受破壞后喪失生產蛋白質的能力和繁殖能力，從而達到滅菌目的。紫外線的殺過程是一個物理過程，其對微生物的遺傳物質DNA或RNA的直接作用幾乎不具有限制性，先已知的致病微生物都能在0.1-2秒內被紫外線殺滅，可見紫外線是譜的消毒技術之一。
紫外線不會對水體添加任何物質，不會產生任何副產品，具有高效、環保、安全的特點。經紫外線消毒后，不存在二次污染及副產物，出水可回用于農田、林地等灌溉或回注水地下，實現資源化。紫外線分為UVA、UVB和UVC三波段，具有殺菌功能的是UVC，其中波長為253.7nm的紫外線殺菌能力，一般對紫外線管的優劣評價只要取決于該波段輸出的效能。
