性能指標
- 測序讀長:平均讀長 3-12 Kb,最長可達30Kb;
- 一致性準確率:一致性準確率可達 99.99%;
- GC含量檢測能力:無需PCR擴增,適合GC含量基因組;
- 堿基修飾:可直接讀取,并可以檢測未知堿基修飾及DNA損傷類型;
- 有效數(shù)據(jù)產(chǎn)量/Cell:0.5-1.2G/Cell;
- 輸出數(shù)據(jù)格式和數(shù)據(jù)兼容性:數(shù)據(jù)格式和二代兼容;
- 軟件:smrt analysis提供二級數(shù)據(jù)分析
主要應(yīng)用
- 應(yīng)用于NGS文庫構(gòu)建、核酸提取、濃度均一化、PCR/qPCR/ddPCR體系構(gòu)建、Pooling、Hit Picking、質(zhì)譜樣品前處理、微生物培養(yǎng)等液體操作實驗。
- 為生命科學(xué)、醫(yī)學(xué)、免疫學(xué)、化學(xué)、農(nóng)學(xué)、環(huán)境科學(xué)、神經(jīng)生物學(xué)等研究領(lǐng)域提供專業(yè)的技術(shù)支撐服務(wù)。
樣品要求
- 來樣須知: 動植物組織>2g; 排泄物:液體類(膽汁等)>600ul;糞便>1.5g; 唾液>5ml; 血液(抗凝)>1ml; 水樣類液體樣本>500ml,或提供提供過濾相應(yīng)體積水的濾膜(如微生物含量少,需增加送樣量); 土壤類>1.5g; 基因組DNA總量>1.5ng,濃度>10ng/ul; PCR產(chǎn)物總量>10ng; 總RNA>4ug,濃度>80ng/ul; DNA文庫類:濃度>4nM,體積>20ul(需提供建庫方式說明); 未曾反復(fù)凍融; 未曾暴露在高溫環(huán)境(>65°C)和PH環(huán)境(< 6或> 9); 未經(jīng)熒光染色或紫外照射(避免EB染色); 不包含變性劑(如guanidinium salts 或 phenol)和洗滌劑(如SDS或Triton-X100); 不包含不溶解的物質(zhì); 不包含來自原始樣本的污染物(如heme, humic acid, polypheno等); DNA樣本中不包含蛋白、RNA、糖類等污染; OD260/OD280 范圍在1.8 - 2.0(DNA),2.0-2.2(RNA); OD260/OD230 約為2.0; 抗凝劑:可用或EDTA,不建議用肝素; 損傷較嚴重樣品需提前說明,并與儀器操作人員聯(lián)系;病毒、致病微生物等危險性樣本恕不接收。
儀器說明
- Biomek i7自動化工作站,其是一款中高通量的實驗設(shè)備,具有多功能的工作空間、靈活的實驗管理流程和簡單的操作系統(tǒng)等特點。
- 可以實現(xiàn)全自動化完成實驗流程,能夠提高實驗結(jié)果的可靠性,增加無人值守時間。