醫院污水是指醫院（綜合醫院、專業病院及其它類型醫院）向自然環境或城市管道排放的污水。其水質隨不同的醫院性質、規模和其所在地區而異。每張每天排放的污水量約為200-1000L。醫院污水中所含的主要污染物為：病原體（寄生蟲卵、病原菌、病毒等）、有機物、漂浮及懸浮物、放射性污染物等，未經處理的原污水中含菌總量達10^8個/mL以上。醫院污水處理的原則是：分質分流，局部分隔治理，把污染就近消滅在污染源。主要處理方法為沉淀與消毒。，為了提高消毒效率及不產生二次污染多趨向采用臭氧化法消毒，消毒處理后均可達到排放標準。處理過程中產生的污泥常采用石灰消毒法及高溫堆肥法進行處理。

根據國家環保總局的有關規定（國家環保總局.醫院污水處理技術指南.2003.12（環發（2003）197號 ），將各類醫院按性質分為綜合醫院和傳染病醫院兩類，與衛生系統對醫院及醫療機構的劃分方法有差別。其中傳染病醫院指傳染性疾病專科醫院和帶傳染病房的綜合醫院，綜合醫院為不帶傳染病房的綜合醫院和各類非傳染性疾病的專科醫院。醫院污水凈化包括綜合醫院、中醫醫院、中西醫結合醫院、民族醫院和專科醫院（傳染病醫院（包括結核病院）、心血管病醫院、腫瘤醫院、口腔醫院、婦產科醫院和精神病醫院等等）各類醫院污水的處理，同時也包括療養院、康復醫院等其它醫療機構和獸醫院的污水處理工程。

醫院污水的性質指醫院產生的含原體、重金屬、消毒劑、有機溶劑、酸、堿以及放射性等的污水。醫院產生污水的主要部門和設施有：診療室、化驗室、病房、洗衣房、X光照像洗印、動物房、同位素治療診斷、手術室等排水；醫院行政管理和醫務人員排放的生活污水，食堂、單身宿舍、家屬宿舍排水。

醫院污水來源及成分復雜，含原性微生物、有毒、有害的物理化學污染物和放射性污染等，具有空間污染、急性傳染和潛伏性傳染等特征，不經有效處理會成為一條疫病擴散的重要途徑和嚴重污染環境：

1）醫院污水受到糞便、傳染性xi jun和病毒等病原性微生物污染，具有傳染性，可以誘發疾病或造成傷害；

2）醫院污水中含有酸、堿、懸浮固體、BOD、COD和動植物油等有毒、有害物質；

3）牙科治療、洗印和化驗等過程產生污水含有重金屬、消毒劑、有機溶劑等，部分具有致癌、致畸或致突變性，危害人體健康并對環境有長遠影響；

4）同位素治療和診斷產生放射性污水。放射性同位素在衰變過程中產生a-、β-和γ-放射性，在人體內積累而危害人體健康。