消毒對水產養殖的病害發生主要起預防作用，利用消毒產品的氧化性及對病原體滲透壓的改變，破壞水體中病原微生物的膜結構，使病原體中酶和蛋白質失去活性，進而致其死亡。可殺滅水體中的病原微生物，降低魚類感染的風險，減少魚病的發生，并能調節水質。
水產養殖消毒臭氧發生器功能機理：
(1)去除水中無機和有機污染物的作用
在水產養殖用水處理中，臭氧可以氧化水中的無機物和有機物。臭氧在氧化水中污染物中，主要有兩種方式，一種是臭氧可以直接對水中污染物進行氧化，達到凈化水質的目的。另外一種是臭氧可以在水中形成活性更強的羥基自由基，對水中污染物進行問接氧化，可以有效去除水中污染物，更好的促進水產養殖業健康發展。
(⑵消毒作用機理
在水產養殖用水處理中，臭氧可以對病毒和致病菌進行滅殺，達到凈化水質的效果。臭氧可以直接破壞細胞器和核糖核酸，讓其失去活性，達到對病毒滅殺的效果。另外臭氧對致病菌的滅殺作用中，主要表現在以下幾個方面，一是臭氧可以作用在致病菌的細胞膜上，使的細胞內容物流失，導致細胞失去活性，達到滅殺效果。二是臭氧可以直接作用在致病菌的酶系統，導致細胞失活，導致致病菌死亡，達到對水質凈化的效果。
水產養殖消毒臭氧發生器應用領域：
家庭、企事業、機關、學校、幼兒園、敬老院、配菜中心、賓館、酒店、快餐店醫院等集體食堂。食品加工車間殺菌、食品加工設備消毒，冷庫消毒，生產車間空氣滅菌凈化,KTV去味消毒。蔬菜水果加工、貯藏及防霉保鮮、生產工具容器、包裝物等的消毒殺菌。
